要确保论文修改后通过知网检测系统，首先应该进行仔细的查重和修改工作。对于已知的重复内容，需要进行适当的修改或删除，确保论文的原创性。同时，注意格式规范，包括参考文献格式、标点符号等，以免因格式问题被检测系统误判。另外，可以请同行或老师帮忙审阅，发现问题及时修改。最后，建议使用专业的查重软件进行自查，确保修改后的论文通过知网检测系统。

除了上述方法，论文修改后还可以通过适当增加新的观点、数据或案例来提升原创性，避免被检测系统认定为抄袭。此外，注意引用格式的准确性，避免因引用不规范而被误判。另外，可以尝试修改文章结构，调整段落顺序或逻辑，使整体呈现更为清晰和连贯，提高通过检测的几率。最重要的是，保持耐心和细心，认真对待每一次修改，最终才能确保通过知网检测系统。